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相關(guān)文獻(xiàn)
經(jīng)典案例
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
案例1 circRNA在外泌體中廣泛而穩(wěn)定的存在，可作為潛在的癌癥診斷標(biāo)志物
研究背景
近些年來發(fā)現(xiàn)circRNA是一種廣泛分布的內(nèi)源性非編碼RNA，能夠調(diào)控基因表達(dá)。circRNA具有細(xì)胞、組織甚至發(fā)育階段特異性。外泌體中存在著很多蛋白質(zhì)，mRNA，microRNA，這些物質(zhì)調(diào)控著細(xì)胞的行為，可能會作為疾病診斷標(biāo)志物。而外泌體中的circRNA卻沒有被報(bào)道過。本研究首次通過circRNA測序鑒定外泌體中的circRNA種類。
研究方法
研究結(jié)果
1 細(xì)胞與細(xì)胞外泌體中的circRNA。
2 人血液外泌體circRNA在基因組上的分布。
研究結(jié)論
本研究揭示了外泌體中的一類新的RNA分子circRNA，并且發(fā)現(xiàn)癌癥病人血清中的外泌體circRNA與正常人的外泌體circRNA顯著不同，可能會成為一類有效的癌癥診斷標(biāo)志物。
案例2 circRNA是一大類具有調(diào)控潛能的RNA分子
研究背景
circRNA是一類較為神秘的尚未弄清功能的RNA分子，為了系統(tǒng)的研究circRNA，本研究對人、小鼠和線蟲進(jìn)行了測序。
研究方法
研究結(jié)果
lncRNA個(gè)體間表達(dá)差異聚類熱圖。a:circRNA鑒定原理圖；b，c：人多個(gè)類型細(xì)胞中circRNA的數(shù)量；d：circRNA在基因組上的分布。
研究結(jié)論
需要更全面的對這些低表達(dá)和高組織特異性的lncRNA進(jìn)行注釋。同時(shí)，當(dāng)我們對人類的lncRNA進(jìn)行深入的注釋或者將其用于預(yù)后或疾病的標(biāo)志物時(shí)，也要考慮到個(gè)體之間lncRNA表達(dá)的差異。本研究鑒定了大量的表達(dá)良好，穩(wěn)定存在，同時(shí)具有組織和發(fā)育階段特異性的circRNA。另外，發(fā)現(xiàn)了一種來源于CDR1as基因的circRNA，具備強(qiáng)力吸附miR-7的能力，顯示出circRNA能夠通過調(diào)節(jié)miRNA的表達(dá)量調(diào)節(jié)基因的功能。
參考文獻(xiàn)
1、Circular RNA is enriched and stable in exosomes: a promising biomarker for cancer diagnosis. [Cell Research, 2015]
2、Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. [Nature, 2013]
