常見問題
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
1、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢(shì)?
答:?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序具有以下優(yōu)勢(shì):(1)可以直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度,同時(shí)不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號(hào)帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測(cè)細(xì)胞中少至幾個(gè)拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;(3)可以對(duì)任意物種進(jìn)行全基因組分析,無需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對(duì)任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,同時(shí)能夠檢測(cè)未知基因,發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本,并準(zhǔn)確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,UTR區(qū)域;(4)檢測(cè)范圍廣,高于6個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍,能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
2、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能得到哪些結(jié)果?
答:?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是用于當(dāng)個(gè)細(xì)胞或少量細(xì)胞mRNA表達(dá)量定量的技術(shù),可以得到樣本中所有表達(dá)基因的表達(dá)量。與基因芯片相比,除了對(duì)基因定量之外,還能對(duì)基因的可變剪切,突變位點(diǎn),融合基因,是否是新轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分析。
3、貴公司的分析除了標(biāo)準(zhǔn)分析,后續(xù)可以個(gè)性化分析?
答:生因生物首先會(huì)給客戶一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)分析,標(biāo)準(zhǔn)分析涵蓋了絕大部分研究所需要的數(shù)據(jù),通??梢詽M足需求。同時(shí)可提供數(shù)據(jù)非常規(guī)分析,可針對(duì)各個(gè)項(xiàng)目,各個(gè)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行個(gè)性化分析。
4、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有什么要求嗎,需要做生物學(xué)重復(fù)嗎?
答:?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序同其它實(shí)驗(yàn)一樣,為了消除個(gè)體差異,實(shí)驗(yàn)操作差異等影響,得到更為科學(xué)的可重復(fù)的結(jié)果,建議每組做三個(gè)以上的重復(fù)。
5、準(zhǔn)備樣品時(shí),有什么注意事項(xiàng)呢?
答:收樣品時(shí)注意兩點(diǎn),第一,保證能夠提供高質(zhì)量的的單細(xì)胞;第二,保證RNA的完整性,RNA降解無法進(jìn)行建庫測(cè)序,應(yīng)注意收集樣品的規(guī)范操作
6、項(xiàng)目周期是多久?
答:樣品合格情況下,為40天。
