常見(jiàn)問(wèn)題
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見(jiàn)問(wèn)題
1 單細(xì)胞全基因組測(cè)序有什么優(yōu)勢(shì)?
答:?jiǎn)渭?xì)胞全基因組測(cè)序可以解決多細(xì)胞群體異質(zhì)性問(wèn)題,對(duì)單個(gè)細(xì)胞的功能及基因組的變化進(jìn)行研究。
2 全基因組測(cè)序的測(cè)序深度多少合適?
答:測(cè)序深度根據(jù)研究目的、樣本量、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)確定。通常30×測(cè)序深度即可檢測(cè)絕大部分SNV,如果客戶的研究目的是尋找癌組織中較大的結(jié)構(gòu)變異、少數(shù)腫瘤細(xì)胞攜帶的低豐度的突變,建議測(cè)序深度至少50×以上。
3 貴公司的分析除了標(biāo)準(zhǔn)分析,后續(xù)可以個(gè)性化分析?
答:生因生物首先會(huì)給客戶一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)分析,標(biāo)準(zhǔn)分析涵蓋了絕大部分研究所需要的數(shù)據(jù),通常可以滿足需求。同時(shí)可提供數(shù)據(jù)非常規(guī)分析,可針對(duì)各個(gè)項(xiàng)目,各個(gè)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行個(gè)性化分析。
4 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有什么要求嗎,需要做多少生物學(xué)重復(fù)嗎?
答:?jiǎn)渭?xì)胞基因組測(cè)序是在單個(gè)細(xì)胞水平上進(jìn)行,細(xì)胞發(fā)育階段、個(gè)體、實(shí)驗(yàn)操作都會(huì)對(duì)單個(gè)細(xì)胞的狀態(tài)產(chǎn)生影響,應(yīng)盡可能多的選擇細(xì)胞。
5 準(zhǔn)備樣品時(shí),有什么注意事項(xiàng)呢?
答:收樣品時(shí)注意兩點(diǎn),第一,保證能夠提供足量的DNA,單細(xì)胞基因組測(cè)序要求DNA ≥10ng;第二,保證DNA的完整性,DNA降解影響建庫(kù)測(cè)序質(zhì)量,應(yīng)注意收集樣品的規(guī)范操作。
6 項(xiàng)目周期是多久?
答:樣品合格情況下,為40天。
