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相關(guān)文獻(xiàn)
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技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
使用限制性內(nèi)切酶關(guān)聯(lián)的二代測序構(gòu)建高密度的遺傳圖譜
研究背景
遺傳圖譜的構(gòu)建和QTL的檢測對于提高植物的品質(zhì)和繁殖能力是非常重要的。構(gòu)建高密度和高質(zhì)量的遺傳圖譜對于生產(chǎn)高品質(zhì)的滿足人類的葡萄是很有幫助的。二代測序由于高通量和低廉價(jià)格已經(jīng)廣泛的用于基因組的研究。限制性位點(diǎn)相關(guān)的DNA測序（RAD）將是一個(gè)有效的測序用于定位基因型。結(jié)合二代測序與RAD已經(jīng)被證明對SNP標(biāo)記的發(fā)展是很有效的。
研究方法
研究結(jié)果
1 限制性內(nèi)切酶消化位點(diǎn)的分布。
2 F1代、親代有效的reads數(shù)目和覆蓋度。
3 組1-5（Z190×Beihong）連鎖分析。
4 基因型與表型共線性分析。
研究結(jié)論
本研究展示了RAD而二代測序用于F1代的基因型的開發(fā)，并且使用我們設(shè)計(jì)的SNP標(biāo)記成功的開發(fā)了高密度和高質(zhì)量的遺傳圖譜。細(xì)節(jié)分析顯示這種新的開發(fā)遺傳圖譜的方法可能會(huì)用于各種各樣的基因組的研究，比如QTL檢測，序列組裝和基因組比較。
參考文獻(xiàn)
Construction of a high-density genetic map for grape using next generation restriction-site associated DNA sequencing. [BMC Plant Biology, 2012]
