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基因組測序
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Hi-C輔助基因組組裝
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技術(shù)介紹
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技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
技術(shù)簡介
Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)，利用高通量測序技術(shù)，結(jié)合生物信息分析方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息?；贖i-C數(shù)據(jù)中染色質(zhì)片段間的交互強度呈現(xiàn)出隨距離衰減的規(guī)律，Hi-C可以用于基因組組裝，將雜亂的基因序列組裝到染色體水平。該技術(shù)可以利用單個個體就可以將基因組序列定位到染色體水平，從而進行染色體水平的研究?，F(xiàn)在已經(jīng)證明Hi-C技術(shù)在人、小鼠、果蠅、擬南芥等基因組輔助組裝中取得了較好的效果。
技術(shù)優(yōu)勢
1、具有更高的覆蓋率和特異性，覆蓋率高達95%；
2、無需繁瑣的群體構(gòu)建工作，單個個體即可完成染色體水平組裝；
3、可適用于難以構(gòu)建遺傳圖譜的物種基因組。
樣本要求
基因組DNA ≥10ug；細胞 ≥5×106個；組織≥40mg
實驗周期
60天
生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺，可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級期刊，平均影響因子達到6。
